آزمایش ژنتیک در بین جمعیت ها بهینه شده است تا شکاف های سلامت را برطرف کند

محققان امتیازات خطر چند ژنی موجود را با استفاده از سوابق سلامت و داده‌های ژنومی متنوع از اجداد بهبود بخشیدند. اعتبار: داریل لجا، موسسه ملی تحقیقات ژنوم انسانی

آزمایش ژنتیکی بهبودیافته خطر بیماری را بدون در نظر گرفتن زمینه ژنتیکی با دقت بیشتری ارزیابی می کند.

برای جلوگیری از کمک فن آوری ژنومی نوظهور به نابرابری های بهداشتی، یک تیم تحقیقاتی با بودجه موسسه ملی بهداشت راه های جدیدی برای بهبود روش آزمایش ژنتیکی به نام a امتیاز ریسک چند ژنی. از آنجایی که نمرات خطر چند ژنی برای همه جمعیت ها موثر نیست، محققان این آزمایش های ژنتیکی را با استفاده از داده های ژنومی متنوع از اجداد، مجددا کالیبره کرده اند. همانطور که امروز (19 فوریه) در طب طبیعیتست های بهینه ارزیابی دقیق تری از خطر بیماری در میان جمعیت های مختلف ارائه می دهند.

پرداختن به چالش تنوع اجدادی

آزمایش‌های ژنتیکی تفاوت‌های کوچک بین ژنوم افراد را بررسی می‌کنند که به آن معروف است انواع ژنومیو امتیاز خطر چند ژنی ابزاری برای ارزیابی بسیاری از گونه های ژنومی در سراسر ژنوم برای تعیین خطر بیماری یک فرد است. با افزایش استفاده از امتیازهای خطر چند ژنی، یکی از نگرانی‌های اصلی این است که مجموعه داده‌های ژنومی مورد استفاده برای محاسبه امتیازات اغلب به میزان زیادی بیش از حد افراد با اصل و نسب اروپایی را نشان می‌دهند.

دکتر نیال لنون، ​​دانشمند مؤسسه براد در کمبریج، ماساچوست و اولین نویسنده این نشریه، گفت: اخیراً، مطالعات بیشتر و بیشتری داده‌های ژنومی چند اجدادی را در توسعه امتیازهای خطر چند ژنی گنجانده‌اند. با این حال، هنوز در بسیاری از نتایجی که تا به امروز ایجاد شده‌اند، شکاف‌هایی در بازنمایی اجداد ژنتیکی وجود دارد.

این «شکاف‌ها» یا داده‌های از دست رفته می‌تواند منجر به نتایج مثبت کاذب شود، که در آن فرد ممکن است در معرض خطر بالای بیماری باشد اما نتیجه پرخطر دریافت نمی‌کند زیرا گونه‌های ژنومی آن‌ها نشان داده نمی‌شود. اگرچه نابرابری‌های بهداشتی اغلب ناشی از تبعیض سیستمیک است تا ژنتیک، این نتایج جعلی راهی است که در آن ابزارهای ژنتیکی ناعادلانه می‌توانند نابرابری‌های موجود در سلامت را تشدید کنند.

پر کردن شکاف در بازنمایی ژنتیکی

در مطالعه جدید، محققان امتیاز خطر چند ژنی موجود را با استفاده از سوابق سلامت و داده های ژنومی اجداد مختلف بهبود بخشیدند. بر همه ما برنامه تحقیقاتیابتکاری با بودجه NIH برای جمع آوری داده های بهداشتی از بیش از یک میلیون نفر با پیشینه های مختلف.

را همه ما این مجموعه داده نشان دهنده حدود سه برابر تعداد افراد با اصل و نسب غیر اروپایی در مقایسه با سایر مجموعه داده های اصلی است که قبلاً برای محاسبه امتیازهای ریسک چند ژنی استفاده می شد. همچنین شامل هشت برابر افراد با نسب دو یا چند جمعیت جهانی می شود. بازنمایی قوی از این افراد کلیدی است، زیرا احتمال بیشتری نسبت به سایر گروه‌ها برای دریافت نتایج گمراه‌کننده از تخمین‌های ریسک چند ژنی وجود دارد.

محققان نمرات خطر پلی ژنیک را برای 10 بیماری رایج از جمله سرطان سینه، سرطان پروستات، بیماری مزمن کلیوی، بیماری عروق کرونر قلب، آسم و دیابت انتخاب کردند. نمرات خطر چند ژنی به ویژه برای ارزیابی خطر برای شرایطی مفید است که از ترکیبی از چندین عامل ژنتیکی ناشی می شود، همانطور که در مورد 10 شرایط انتخاب شده وجود دارد. بسیاری از این شرایط بهداشتی نیز با نابرابری های بهداشتی مرتبط هستند.

پیامدها و پیامدها برای برابری سلامت

محققان گروه‌های مختلف اجدادی را گردآوری کردند همه ما داده ها شامل افراد با و بدون هر بیماری. گونه‌های ژنومی ارائه‌شده در این گروه‌ها به محققان این امکان را می‌دهد تا نمرات خطر چند ژنی را برای افراد با اصل و نسب غیر اروپایی تنظیم مجدد کنند.

با نتایج بهینه شده، محققان خطر بیماری را برای گروهی از 2500 نفر که از نظر نژادی متفاوت بودند، تجزیه و تحلیل کردند. تقریباً از هر 5 شرکت‌کننده، 1 نفر در خطر ابتلا به حداقل یکی از 10 بیماری قرار داشت.

مهمتر از همه، این شرکت کنندگان در اصل و نسب خود بسیار متفاوت بودند، که نشان می دهد نمرات خطر چند ژنی مجدداً برای افراد اروپایی تبار مغرضانه نیست و برای همه جمعیت ها مؤثر است.

دکتر لنون می‌گوید: «مدل ما این احتمال را که فردی در انتهای توزیع پرخطر قرار دارد، بدون توجه به اصل و نسب ژنتیکی‌اش، به شدت افزایش می‌دهد. «تنوع همه ما مجموعه داده برای توانایی ما برای انجام این کار بسیار مهم بود.

با این حال، این نتایج بهینه به تنهایی نمی توانند نابرابری های سلامت را برطرف کنند. دکتر لنون “نتایج خطر پلی ژنیک تنها برای بیمارانی مفید است که می توانند برای پیشگیری از بیماری یا ابتلای زودهنگام به آن اقدام کنند، و افرادی که دسترسی کمتری به مراقبت های بهداشتی دارند نیز برای دریافت پیگیری های توصیه شده، مانند معاینات مکرر، مشکل دارند.” گفت.

با این حال، این کار گام مهمی در جهت استفاده معمول از امتیازهای خطر چند ژنی در کلینیک به نفع همه افراد است. 2500 شرکت‌کننده در این مطالعه تنها یک نگاه اولیه به نمرات خطر چند ژنی بهبود یافته را نشان می‌دهند. شبکه پرونده های الکترونیکی پزشکی پزشکی و ژنومیک (eMERGE) NIH این تحقیق را با ثبت نام در مجموع 25000 شرکت کننده از جمعیت های مختلف در مرحله بعدی مطالعه ادامه خواهد داد.

مرجع: «انتخاب، بهینه‌سازی و اعتبار دهی امتیاز خطر بیماری مزمن چند ژنی برای کاربرد بالینی در جمعیت‌های متنوع ایالات متحده» توسط Niall J. Lennon، Leah C. Kottyan، Christopher Kachulis، Noura S. Abul-Husn، Josh Arias، Gillian Belbin. ، جنیفر ای. بلو، سونجا آی. برنت، وندی کی. چانگ، جیمز جی. چیمینو، الن رایت کلیتون، جان جی. کانلی، دیوید آر. کراسلین، اوزان دیکیلیتاس، دیگنا آر. کاندیس پترسون، هاکون هاکونارسون، میگان هاردن، مارگارت هر، جوئل ان. هیرشهورن، کلایو هوگارت، لی هسو، مارگریت آر. اروین، گیل پی جارویک، الیزابت دبلیو. کتی لارکین، نیتا لیمدی، جودل ای. لیندر، روث جی اف لوس، یوان لو، ادیتا مالوپسزا، تری آ. مانولیو، لیزا جی. مارتین، لی مک کارتی، الیزابت ام. مک نالی، جیمز بی میگز، تسفای بی. مرشا، جاناتان دی. موزلی، آنژن موزیک، بهرام نامجو، نیهال پای، لورنزو ال. پسچه، اولریکه پیترز، جاش اف. پترسون، سینتیا ای. پروس، مگان جی. Puckelwartz، Heidi L. Rehm، Dan M. Roden، Elizabeth A. Rosenthal، Rob Rowley، Konrad Theodore Sawicki، Daniel J. Scheid، Roeloff AJ Smith، Johanna L. Smith، Jordan W. Smoller، Minta Thomas، Hemant Tiwari، Diana M. Toledo، Nataraja Sarma Vaithinadin، David Veenstra، Teresa L. Valunas، Zhe Wang، Wei-Qi Wei، Chunhua Weng، Georgia L. Wisner، Xianyong Ying و Eimear E. Kenny، 19 فوریه 2024، طب طبیعی.
DOI: 10.1038/s41591-024-02796-z